22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0889 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 134 aa  270  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  65.12 
 
 		 135 aa  167  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.46 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  60.47 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.64 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.14 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.36 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.79 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.7 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.36 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.38 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.35 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.27 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.84 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  22.48 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  20.77 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.8 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.8 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  29.36 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>