71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0048 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.4 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.68 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.56 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.39 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.89 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.41 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.48 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.73 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.91 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.58 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.15 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.12 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.77 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.65 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.52 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6061  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.09 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  30.83 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.91 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.91 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.12 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.98 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.95 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.61 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.46 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.98 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.26 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.47 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.3 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  20.77 
 
 		 134 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.87 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.72 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.33 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.33 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.33 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.33 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.33 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.22 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.21 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1219  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.84 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.67 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.33 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 		 138 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.66 
 
 		 133 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.39 
 
 		 148 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30 
 
 		 138 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>