41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2990 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.79 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.8 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.18 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.09 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.68 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.85 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.12 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.12 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.71 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.32 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.8 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.84 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.37 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0140  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.74 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  25 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.41 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.11 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.11 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.11 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.07 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  27.68 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.31 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.74 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.93 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.97 
 
 		 146 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.89 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.17 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.98 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>