19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0951 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  76.74 
 
 
129 aa  202  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  70.54 
 
 
139 aa  184  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  68.22 
 
 
131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  66.67 
 
 
130 aa  176  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  60.9 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  65.12 
 
 
134 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.56 
 
 
138 aa  149  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.04 
 
 
129 aa  141  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.16 
 
 
133 aa  140  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.16 
 
 
129 aa  127  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.85 
 
 
126 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.08 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.48 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.71 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.95 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.61 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.97 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.15 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>