More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8187 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  707    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  46.72 
 
 		 357 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 		 350 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.92 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.17 
 
 		 350 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 		 355 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.14 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.44 
 
 		 352 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  35.14 
 
 		 352 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.93 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.91 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.8 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.05 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.7 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  36.44 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.73 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.24 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.11 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.96 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.14 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.37 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  32 
 
 		 347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.14 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.01 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.25 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32 
 
 		 353 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.43 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 		 345 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.75 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  31.98 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.64 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.66 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.18 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.52 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.94 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.73 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.55 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.64 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.37 
 
 		 342 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 		 348 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 		 356 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.51 
 
 		 340 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.93 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>