More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7591 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7591  ABC transporter membrane spanning protein  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.52 
 
 
295 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5330  ABC transporter  52.96 
 
 
274 aa  271  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3552  hypothetical protein  51.79 
 
 
270 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.9 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247305  normal  0.0147322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
278 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 
273 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63709  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1084  putative sugar ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
273 aa  208  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1181  sugar ABC transporter, permease protein, putative  43.8 
 
 
273 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  41.94 
 
 
272 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
272 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  42.09 
 
 
273 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
270 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
270 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.83 
 
 
302 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
275 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
271 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
273 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
273 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0449998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
273 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
275 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
281 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
295 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  35.79 
 
 
277 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
282 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
307 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
295 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
321 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0784866  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 
278 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
271 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
296 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  35.34 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.84 
 
 
296 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
285 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 
277 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30850  ABC-type sugar transport system, permease component  30.6 
 
 
315 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
274 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  34.43 
 
 
278 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
275 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
297 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
299 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0352539  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  33.58 
 
 
290 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
277 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
274 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
298 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1482  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.26 
 
 
272 aa  148  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00114182  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  32.6 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.390959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107146  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
298 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
307 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
278 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.84 
 
 
304 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.13 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
300 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
275 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
273 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  32.46 
 
 
277 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
285 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
307 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
291 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000539502  hitchhiker  0.00573308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
303 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
296 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.500307  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
268 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.620459  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
275 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
299 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.33 
 
 
278 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
301 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
324 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
268 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 
292 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
268 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  31.18 
 
 
286 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
299 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
279 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0806983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
300 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
280 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.697078  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
281 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
390 aa  142  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>