53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6083 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  88.5 
 
 		 200 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  88 
 
 		 200 aa  362  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  86 
 
 		 200 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  74.49 
 
 		 200 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  71.79 
 
 		 195 aa  290  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  69 
 
 		 199 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  62 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  58.16 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  58.67 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  58.67 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  58.67 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  56.63 
 
 		 196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  57.65 
 
 		 196 aa  230  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  56.12 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  54.55 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  52.33 
 
 		 196 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  52.11 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  51.79 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  52.13 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  45.11 
 
 		 221 aa  157  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  46.07 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  42.62 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  39.25 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  39.89 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  38.54 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  36.87 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  38.04 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  37.5 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  36.26 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  36.26 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  37.77 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  38.25 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  36.07 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  38.8 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  35.75 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  37.7 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  36.67 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  37.43 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  35 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  35.56 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  35.91 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  35.75 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  31.87 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  38.21 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  31.35 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  31.35 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  32.34 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  32.34 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  30.48 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  30.05 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>