More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5437 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  82.78 
 
 
211 aa  360  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  78.74 
 
 
219 aa  341  5.999999999999999e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.29 
 
 
215 aa  329  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.09 
 
 
214 aa  326  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0958  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.19 
 
 
216 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223277  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0573  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.52 
 
 
211 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109491  normal  0.423863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.86 
 
 
211 aa  310  9e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  68.54 
 
 
216 aa  309  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.87 
 
 
213 aa  309  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.4 
 
 
213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.92 
 
 
213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  68.54 
 
 
213 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.25 
 
 
209 aa  301  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.62 
 
 
226 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.95 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  67.45 
 
 
213 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  67.45 
 
 
213 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  67.45 
 
 
213 aa  300  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  67.45 
 
 
213 aa  300  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  67.45 
 
 
213 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  67.45 
 
 
213 aa  300  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  67.45 
 
 
213 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.57 
 
 
213 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  71.5 
 
 
216 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.12 
 
 
221 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.45 
 
 
213 aa  298  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  72.3 
 
 
220 aa  298  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.92 
 
 
213 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.98 
 
 
213 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.03 
 
 
216 aa  297  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  70.56 
 
 
216 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.45 
 
 
213 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.45 
 
 
213 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.45 
 
 
213 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  70.09 
 
 
216 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.94 
 
 
210 aa  294  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.3 
 
 
220 aa  294  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  67.94 
 
 
212 aa  293  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.28 
 
 
212 aa  293  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.67 
 
 
219 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.2 
 
 
219 aa  292  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.74 
 
 
241 aa  292  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1247  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  69.16 
 
 
216 aa  291  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.272064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6365  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.2 
 
 
221 aa  291  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.74 
 
 
219 aa  291  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.82 
 
 
216 aa  289  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6829  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  71.98 
 
 
209 aa  287  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0752786  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.29 
 
 
216 aa  287  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4700  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.53 
 
 
213 aa  286  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230797  normal  0.520807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.68 
 
 
227 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.82 
 
 
212 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.26 
 
 
217 aa  285  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.07 
 
 
208 aa  284  5.999999999999999e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  66.99 
 
 
209 aa  284  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5000  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.13 
 
 
220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  hitchhiker  0.00178091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.99 
 
 
212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.3 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.36 
 
 
212 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0563  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.9 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.68 
 
 
223 aa  280  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.55 
 
 
212 aa  280  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1913  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.9 
 
 
209 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.79 
 
 
236 aa  280  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.2 
 
 
213 aa  279  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3109  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.42 
 
 
209 aa  278  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0179198  normal  0.0278919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.38 
 
 
229 aa  278  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.98 
 
 
218 aa  278  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.51 
 
 
212 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.03 
 
 
211 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.03 
 
 
211 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.03 
 
 
212 aa  275  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.09 
 
 
215 aa  275  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.55 
 
 
208 aa  275  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.94 
 
 
215 aa  275  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.11 
 
 
219 aa  274  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.26 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.75 
 
 
214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.51 
 
 
212 aa  272  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.9 
 
 
209 aa  272  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1005  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.15 
 
 
207 aa  272  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.282605  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.68 
 
 
202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.43 
 
 
218 aa  268  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.98 
 
 
228 aa  268  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.41 
 
 
209 aa  268  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.03 
 
 
213 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.93 
 
 
209 aa  266  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.32 
 
 
212 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.55 
 
 
212 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.55 
 
 
212 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.54 
 
 
229 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.54 
 
 
229 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  60.09 
 
 
218 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.79 
 
 
463 aa  263  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.54 
 
 
229 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  60.09 
 
 
218 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.62 
 
 
218 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.15 
 
 
218 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.62 
 
 
218 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.62 
 
 
218 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>