28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4119 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  278  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  67.15 
 
 		 137 aa  176  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  65.44 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  47.15 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  47.15 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  45.53 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  48.57 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  38.4 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  41.88 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  35.51 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  35.2 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  33.33 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  36.11 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  36.11 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  33.65 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  36.36 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  32.77 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  36.59 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  31.96 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  25.78 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  30.25 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  28.57 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  30.3 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  31.45 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>