116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3295 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  63.76 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  63.41 
 
 		 289 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  42.12 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  39.44 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  37.99 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  38.36 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  36.5 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  37.81 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  31.91 
 
 		 291 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  35.56 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  35.56 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  30.5 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  35.48 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  33.79 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  33.45 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  34.13 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  31.45 
 
 		 284 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  33.79 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  33.79 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  33.22 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  33.79 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  33.79 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  36.75 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  36.1 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  33.45 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  33.79 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  34.36 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  33.1 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  34.26 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  33.79 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  32.53 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  33.22 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  29.71 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  31.82 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  29.1 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  29.17 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  32.3 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  29.37 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  29.73 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  27.38 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  28.91 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  29.28 
 
 		 313 aa  125  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  29.68 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  31.03 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  26.12 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  28.71 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  29.17 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  29.17 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  26.24 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  27.69 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  26.03 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  26.59 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  27.39 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  31.34 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  28.17 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  28.16 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  28.31 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  30.7 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  28.4 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  23.05 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  24.88 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  24.88 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  27.5 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  28.8 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  22.34 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  40.79 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  27.35 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  28 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  24.07 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  33.33 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  29.09 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  26.95 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  26.95 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  26.27 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  26.56 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  24.19 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  27.22 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  24.45 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  26.56 
 
 		 399 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  29.06 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2611  aldose 1-epimerase  25.41 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.100158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  28.91 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  30.43 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  29.51 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  29.36 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  26.99 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  31.03 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  29.25 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  24.56 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  22.53 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  37.37 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>