41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1306 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.14 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.78 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.78 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.35 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0578  putative peptidoglycan-binding protein  32.49 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0578  peptidoglycan-binding protein, putative  32.49 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  48.08 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  48.08 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.62 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 279 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  49.02 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  35.71 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 250 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.21 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  43.14 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  43.14 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  49.02 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.03 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  39.51 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  49.02 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  42.31 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  32.86 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  36.23 
 
 		 228 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 116 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  43.14 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  46.94 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  39.62 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.62 
 
 		 245 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  41.67 
 
 		 236 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0426  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 281 aa  43.5  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.43216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.33 
 
 		 223 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  34.48 
 
 		 231 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  46.51 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.18 
 
 		 462 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>