23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3046 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.94 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.83 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.66 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.81 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.8 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  48.21 
 
 		 193 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.74 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.64 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.74 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.32 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  35.63 
 
 		 413 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 465 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.06 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  47.06 
 
 		 413 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  33.33 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  32.79 
 
 		 374 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  47.06 
 
 		 411 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  44 
 
 		 425 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>