21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2220 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 201 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.28 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  49.28 
 
 		 231 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.11 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.15 
 
 		 266 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.5 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.57 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.45 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.8 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.98 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 279 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.9 
 
 		 276 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 1226 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46 
 
 		 462 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  46 
 
 		 413 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 328 aa  41.2  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>