19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2064 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.25 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.98 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.81 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  46.38 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  40.25 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.02 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.56 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.82 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.88 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.59 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  38.24 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  45.1 
 
 		 413 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0426  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 281 aa  42  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.43216  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  45.1 
 
 		 462 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>