21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2622 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  71.43 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.03 
 
 		 237 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  48.29 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 267 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.03 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.7 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.98 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.65 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.89 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 1226 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 312 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.29 
 
 		 276 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.86 
 
 		 317 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.77 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.74 
 
 		 328 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  45.1 
 
 		 462 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>