26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0699 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 250 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  96.4 
 
 		 250 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  73.73 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  32.84 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.56 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.9 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.16 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.49 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.82 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  32.37 
 
 		 193 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.96 
 
 		 465 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.66 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  38.98 
 
 		 378 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  28.84 
 
 		 374 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  29.32 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  29 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1402  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742289  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.64 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  38.46 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31 
 
 		 283 aa  42  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 77 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>