22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1407 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  34.3 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.55 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.32 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.28 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.89 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.18 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.09 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.09 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  40.68 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.9 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  28.8 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.75 
 
 		 465 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.99 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  33.98 
 
 		 486 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>