24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1780 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.26 
 
 		 267 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 266 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.67 
 
 		 201 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.22 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  48.87 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  52.99 
 
 		 193 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.08 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.87 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.48 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.7 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.54 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.29 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  29.52 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  32.53 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4678  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.74 
 
 		 75 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 1226 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  45.28 
 
 		 413 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  45.28 
 
 		 462 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>