26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0710 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  96.4 
 
 		 250 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  73.33 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  34.74 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.9 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.18 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  34.68 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.88 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.2 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 465 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  38.98 
 
 		 378 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  31.21 
 
 		 374 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.1 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  22.34 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  29.2 
 
 		 3393 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  35.9 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 77 aa  42  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  29.77 
 
 		 3333 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>