29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4662 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.04 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.85 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.92 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  33.66 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.06 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.07 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.88 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.84 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.39 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  46.3 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.79 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 1012 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.74 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.03 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 667 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.77 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  28.75 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  48 
 
 		 997 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  42.86 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  48.98 
 
 		 425 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.36 
 
 		 465 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  27.94 
 
 		 1017 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>