36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0672 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 245 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  78.04 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  76.86 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.93 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  35 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.67 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.22 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.53 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  30.72 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.33 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.15 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.69 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  43.4 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  23.37 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  39.06 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0578  putative peptidoglycan-binding protein  27.85 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0578  peptidoglycan-binding protein, putative  27.85 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 328 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.51 
 
 		 1261 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  39.62 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.03 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.56 
 
 		 549 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  43.08 
 
 		 383 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 1012 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.51 
 
 		 77 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.64 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.13 
 
 		 382 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1506  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.68 
 
 		 334 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.035411  normal  0.13922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>