205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3777 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  100 
 
 
157 aa  326  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  37.18 
 
 
182 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  36.77 
 
 
180 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  36.77 
 
 
180 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  29.45 
 
 
191 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  31.58 
 
 
178 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  31.58 
 
 
178 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  28.1 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  27.74 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  26.17 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  27.27 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  27.35 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  30.88 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  24.32 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  24.32 
 
 
163 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  28 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  28 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  26.67 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  25.79 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  27.39 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  28.17 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  30 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  26.55 
 
 
157 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  26.55 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  26.12 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  26.35 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  25.95 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  25.48 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  24.36 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  22.97 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  25.19 
 
 
147 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  24.32 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  26.05 
 
 
365 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  28.68 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.67 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.01 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  23.45 
 
 
533 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.01 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  24.63 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  22.97 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  28.86 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.48 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  26.12 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  28.77 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  27.01 
 
 
365 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  24.03 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  22.96 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  30.07 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  27.03 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  23.14 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  25.4 
 
 
179 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  22.9 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  27.03 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  27.03 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  21.64 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  24.84 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  25.58 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.45 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  24.24 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  25.45 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  27.4 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  25.45 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  26.61 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.5 
 
 
174 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  24.8 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  25.45 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  29.25 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  23.65 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  23.65 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  27.08 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  24.63 
 
 
161 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  23.14 
 
 
159 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  23.14 
 
 
159 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  25.35 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  29.09 
 
 
187 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  25.2 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  24.83 
 
 
205 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.32 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  26.36 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  30.28 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  25.76 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  23.91 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  28 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  20.86 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  26.61 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  25.76 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  26.79 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  25.19 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  25.81 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  23.81 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  30.28 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  24.46 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  21.62 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  22.63 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  25.52 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  24.6 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  26.79 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  24.6 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  30.21 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>