209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1400 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  100 
 
 		 502 aa  989    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  48.13 
 
 		 416 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  53.24 
 
 		 428 aa  300  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  56.89 
 
 		 425 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 547 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  36.73 
 
 		 492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  36.73 
 
 		 492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  36.52 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  35.74 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  37.23 
 
 		 489 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 454 aa  220  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 459 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 476 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  32.4 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 509 aa  213  9e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 471 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 471 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 471 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  30.78 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 478 aa  206  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 463 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  33.94 
 
 		 489 aa  203  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  29.43 
 
 		 550 aa  200  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  31.47 
 
 		 466 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 472 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 550 aa  194  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 553 aa  193  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  31.08 
 
 		 462 aa  192  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 478 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  53.85 
 
 		 429 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 473 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 473 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  53.85 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  29.53 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 475 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  28.23 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  47.87 
 
 		 419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  29.92 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  50.71 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  28.45 
 
 		 515 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  27.63 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  28.36 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  42.02 
 
 		 409 aa  181  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  29.44 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  30.1 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0879  hypothetical protein  28.29 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.207268  hitchhiker  0.000254267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 450 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  29.9 
 
 		 516 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  29.08 
 
 		 519 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  42.74 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  42.74 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  42.74 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  42.74 
 
 		 493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  42.74 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  48.34 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  48.21 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  29.41 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  41.88 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  42.38 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  41.88 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  41.88 
 
 		 491 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  41.88 
 
 		 491 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  41.88 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  41.88 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  41.88 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  41.88 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  41.99 
 
 		 491 aa  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  42.38 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  27.73 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  28.42 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  48.97 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 441 aa  166  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  38.96 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  38.96 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  38.96 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>