33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0251 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4205  hypothetical protein  64.53 
 
 
809 aa  1045    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  70.25 
 
 
814 aa  1152    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  100 
 
 
819 aa  1689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4244  GTPase (dynamin-related)-like protein  64.53 
 
 
809 aa  1045    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000109098  hitchhiker  0.00000166794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  25.66 
 
 
648 aa  57.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  25.66 
 
 
662 aa  55.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  26.89 
 
 
648 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  26.58 
 
 
651 aa  56.2  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  25 
 
 
1219 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.81 
 
 
1249 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  22.98 
 
 
793 aa  50.8  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  32.14 
 
 
659 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  27 
 
 
672 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  24.51 
 
 
648 aa  50.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  33.07 
 
 
658 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  29.29 
 
 
649 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  22.62 
 
 
712 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.77 
 
 
741 aa  47.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  26.37 
 
 
789 aa  47.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  22.62 
 
 
712 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  32.38 
 
 
655 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  24.31 
 
 
654 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  32.38 
 
 
655 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  34.62 
 
 
551 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  36.14 
 
 
655 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  27.03 
 
 
659 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  25.45 
 
 
653 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  25.67 
 
 
660 aa  45.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  25.67 
 
 
660 aa  45.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  27.27 
 
 
648 aa  45.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  31 
 
 
654 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.66 
 
 
614 aa  45.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  31.76 
 
 
652 aa  44.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>