38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1655 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  53.85 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  43.16 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  40.86 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  35.24 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  40.58 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  41.46 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  58.14 
 
 		 53 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  33.75 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13820  Nucleotidyltransferase domain protein  36.84 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  28 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  31.08 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  31.63 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  44.26 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  43.4 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  32.76 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  35.06 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  29.11 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  61.29 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  36.49 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  35.06 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  30.1 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  57.14 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.71 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  36.62 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  44 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>