55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1607 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  54.49 
 
 		 259 aa  188  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  37.13 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  37.37 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  35.1 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  38.27 
 
 		 355 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  38.89 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  36.78 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  39.77 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  38.33 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  38.33 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  42.94 
 
 		 262 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  39.56 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  40.22 
 
 		 338 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  39.74 
 
 		 259 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  35.56 
 
 		 260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  40.12 
 
 		 329 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  35.8 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  33.67 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  36.05 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  36.61 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  32.58 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  31.14 
 
 		 267 aa  98.2  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  27.4 
 
 		 387 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  33.54 
 
 		 311 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  32.73 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  31.67 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  37.21 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  34.45 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  30.16 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07440  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316107  normal  0.202998 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5568  NERD domain-containing protein  35.06 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.539565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  27.88 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  22.14 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0711  NERD domain-containing protein  27.34 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  32.35 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  32.04 
 
 		 351 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3742  hypothetical protein  28.7 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  33.33 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  30.69 
 
 		 329 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  30.69 
 
 		 329 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  30.69 
 
 		 329 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  30.69 
 
 		 329 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  31.58 
 
 		 353 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  30.69 
 
 		 329 aa  45.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6548  NERD domain-containing protein  25.97 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2688  NERD domain protein  27.35 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000212035  normal  0.0390555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  25.81 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  29.73 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  30.3 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5243  nerd domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  35 
 
 		 281 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  36.76 
 
 		 255 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>