134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3864 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  100 
 
 
267 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  81.75 
 
 
266 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  45.06 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  42.86 
 
 
266 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  43.6 
 
 
249 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  41.67 
 
 
264 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  43.5 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  43.5 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  43.37 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  37.5 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  34.11 
 
 
895 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  37.74 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  35.98 
 
 
313 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  37.24 
 
 
294 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  30.97 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  30.38 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.91 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.91 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.51 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.51 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.51 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.51 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.51 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.51 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  25.78 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  37.5 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  25.91 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  25.7 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.66 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  26.43 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  25.64 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  35.29 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.12 
 
 
811 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  26.23 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  27.93 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  27.11 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.57 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  36.24 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.39 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  26.99 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  30.3 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.85 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.85 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.09 
 
 
656 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.39 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  20.54 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  26.54 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  25.29 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  30.95 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  22.36 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  21.56 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  30.32 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.32 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.5 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  30.17 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  28.48 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.17 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  25.15 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  22.05 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.89 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  28.86 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  26.53 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  32.52 
 
 
764 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  28.91 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.31 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  29.69 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  25.73 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  26.53 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  25.85 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.26 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.11 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  27.21 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  25.85 
 
 
273 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  25.49 
 
 
268 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  25.49 
 
 
268 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  26.82 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  24.89 
 
 
264 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  26.53 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  29.44 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  23.93 
 
 
266 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  40.96 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  28.37 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  30.98 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  28.48 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  27.54 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  25.85 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.46 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  29.03 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  27.82 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  26.97 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  25 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  25.74 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  28.03 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  24.69 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  26.76 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26 
 
 
278 aa  49.3  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 
268 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.99 
 
 
264 aa  49.3  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  27.59 
 
 
265 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>