More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0866 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  72.61 
 
 		 551 aa  819    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0866  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 555 aa  1114    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 		 587 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  43.15 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27560  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 597 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.972218  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  37.32 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  36.78 
 
 		 535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16710  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 554 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0521739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 712 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 625 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.4 
 
 		 589 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 885 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.29 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.29 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.01 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.29 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.29 
 
 		 587 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.01 
 
 		 587 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  32.29 
 
 		 587 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 		 1010 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  32.29 
 
 		 587 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 958 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.29 
 
 		 587 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 585 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  45.58 
 
 		 423 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 600 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 581 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 701 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 587 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 3470 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 584 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 709 aa  157  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 594 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  33.94 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 589 aa  153  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 633 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 815 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 682 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 827 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  29.25 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  31.13 
 
 		 584 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 695 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  33.58 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  33.58 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 718 aa  150  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 639 aa  149  9e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 1039 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 874 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  33.58 
 
 		 464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  36.22 
 
 		 496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  28.73 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 612 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 1042 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  31.17 
 
 		 591 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 621 aa  147  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 591 aa  147  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 377 aa  147  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 590 aa  147  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 722 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 639 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 592 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  38.74 
 
 		 593 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 418 aa  146  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 563 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 608 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  35.41 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 754 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 350 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 514 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 589 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  36.33 
 
 		 346 aa  143  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 755 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  39.25 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  35.02 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 590 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  35.54 
 
 		 581 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 556 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 604 aa  143  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 607 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  30.15 
 
 		 613 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 2153 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>