More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0741 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0741  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  36.53 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  35 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  35 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0993  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  35.43 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  36.48 
 
 		 245 aa  131  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  37.73 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  39.07 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0416  two component transcriptional regulator  35.47 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  34.38 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  37.33 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.43 
 
 		 235 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  34.98 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 799 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  34.98 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  36.41 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  34.98 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  34.98 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  33.04 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1166  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  36.57 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0244  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 272 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  34.08 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 635 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  34.08 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  36.16 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.94 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  32.88 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  35.29 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.79 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.23 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  34.08 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  34.23 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  34.91 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2093  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.582679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.78 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1824  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>