More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0692 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  100 
 
 		 184 aa  376  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  49.7 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  47.98 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  49.13 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  45.41 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  41.4 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  42.37 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  41.71 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  39.88 
 
 		 220 aa  131  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  38.86 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  37.91 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  36.56 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.31 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  39.67 
 
 		 220 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  39.2 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.46 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  39.2 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  43.67 
 
 		 203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  41.81 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  41.81 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  38.27 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  37.28 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  36.36 
 
 		 173 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.33 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  36.67 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  38.59 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  35.47 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  38.29 
 
 		 209 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  35.96 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  36.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  39.44 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  39.31 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  37.42 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  36.87 
 
 		 193 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  34.91 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  36.72 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  35.48 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  40.51 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  33.15 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.27 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  35.45 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  34.15 
 
 		 288 aa  114  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  40.59 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.07 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  36.51 
 
 		 216 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  31.49 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.36 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  32.98 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  32.26 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  32.79 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.27 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  36.49 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  32.02 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  38.31 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  34.22 
 
 		 284 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.33 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  32.46 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.04 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  34.87 
 
 		 233 aa  104  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  30.66 
 
 		 270 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  35.38 
 
 		 313 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  31.41 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  34.05 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  38.42 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  34.07 
 
 		 286 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  32.78 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  36.16 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  32.29 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  36.53 
 
 		 216 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  32.29 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  36.16 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  32.29 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  32.29 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  36.16 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  32.29 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  33.51 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  32.29 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  36.12 
 
 		 288 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  34.25 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  34.25 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  31.96 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  34.3 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  32.05 
 
 		 309 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  36 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  35.79 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  36 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  36 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  30.5 
 
 		 265 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  32.64 
 
 		 256 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  36.63 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  33.91 
 
 		 284 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  34.59 
 
 		 215 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  34.43 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  33.91 
 
 		 284 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  34.44 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  33.91 
 
 		 284 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  33.88 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  36.84 
 
 		 341 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  33.86 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  31.82 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>