206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0149 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  51.04 
 
 		 1500 aa  1533    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  47.81 
 
 		 1424 aa  1364    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  38.42 
 
 		 1503 aa  1019    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  51.33 
 
 		 1415 aa  1519    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  62.98 
 
 		 1578 aa  1917    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  100 
 
 		 1584 aa  3285    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  46.35 
 
 		 975 aa  918    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  46.11 
 
 		 975 aa  914    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  53.04 
 
 		 1428 aa  1568    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  48.39 
 
 		 1436 aa  1389    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  61.01 
 
 		 1661 aa  1879    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  44.7 
 
 		 981 aa  910    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  55.34 
 
 		 1433 aa  1654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  34.92 
 
 		 1461 aa  830    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  53.8 
 
 		 1426 aa  1595    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  51.77 
 
 		 1420 aa  1548    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  47.64 
 
 		 1411 aa  1405    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  48.84 
 
 		 1406 aa  1399    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  61.59 
 
 		 1563 aa  1850    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.65 
 
 		 1444 aa  1123    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.88 
 
 		 1434 aa  999    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  48.23 
 
 		 1416 aa  1370    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  50.61 
 
 		 1421 aa  1441    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  46.54 
 
 		 1647 aa  965    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  52.85 
 
 		 1431 aa  1558    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.85 
 
 		 1206 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.63 
 
 		 1137 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.14 
 
 		 1036 aa  342  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  45.04 
 
 		 419 aa  341  5e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  43.9 
 
 		 420 aa  333  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  43.9 
 
 		 421 aa  332  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.84 
 
 		 1021 aa  319  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.75 
 
 		 1343 aa  315  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.57 
 
 		 1415 aa  291  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.53 
 
 		 1415 aa  289  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  25.64 
 
 		 1354 aa  281  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.87 
 
 		 1500 aa  249  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.59 
 
 		 1487 aa  216  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.25 
 
 		 1422 aa  199  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  23.33 
 
 		 1442 aa  194  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.92 
 
 		 1414 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.78 
 
 		 1437 aa  176  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.85 
 
 		 320 aa  164  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.1 
 
 		 329 aa  153  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.42 
 
 		 327 aa  153  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.38 
 
 		 330 aa  147  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.8 
 
 		 331 aa  146  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.25 
 
 		 327 aa  142  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  31.63 
 
 		 319 aa  141  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.65 
 
 		 324 aa  141  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  33.72 
 
 		 320 aa  140  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.35 
 
 		 336 aa  140  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  31.86 
 
 		 339 aa  138  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.91 
 
 		 344 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.77 
 
 		 347 aa  135  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  31.19 
 
 		 320 aa  135  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.85 
 
 		 329 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  30.86 
 
 		 283 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.47 
 
 		 283 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.63 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.48 
 
 		 339 aa  129  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.94 
 
 		 319 aa  129  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.01 
 
 		 367 aa  128  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.79 
 
 		 283 aa  126  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  29.38 
 
 		 331 aa  126  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  23.06 
 
 		 634 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.65 
 
 		 272 aa  110  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.06 
 
 		 249 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.27 
 
 		 272 aa  107  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.47 
 
 		 253 aa  107  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  26.89 
 
 		 330 aa  106  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.79 
 
 		 262 aa  104  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  25.29 
 
 		 327 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.83 
 
 		 261 aa  103  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28 
 
 		 273 aa  97.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.21 
 
 		 539 aa  96.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  29.18 
 
 		 249 aa  96.3  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.65 
 
 		 267 aa  95.5  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.86 
 
 		 275 aa  95.1  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.35 
 
 		 250 aa  95.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.98 
 
 		 253 aa  93.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  23.28 
 
 		 327 aa  91.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.56 
 
 		 263 aa  90.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.95 
 
 		 260 aa  90.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  27.8 
 
 		 268 aa  90.5  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  21.87 
 
 		 727 aa  90.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  24.85 
 
 		 329 aa  89.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0411  CoA enzyme activase  28.52 
 
 		 258 aa  89  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.83 
 
 		 267 aa  88.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1027  benzoyl-CoA reductase, subunit A  29.26 
 
 		 437 aa  88.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.92 
 
 		 274 aa  88.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  26.44 
 
 		 333 aa  88.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.57 
 
 		 259 aa  87.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.74 
 
 		 272 aa  87.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0546  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.58 
 
 		 263 aa  86.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1536  benzoyl-CoA reductase, subunit A  29.38 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0726  benzoyl-CoA reductase, subunit A  29.38 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.810305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.57 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1148  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.63 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  23 
 
 		 383 aa  85.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>