130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3534 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3534  putative CheW protein  100 
 
 
171 aa  322  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274314  normal  0.0377481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  47.13 
 
 
186 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  37.5 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  34.55 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  36.54 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  38.79 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  35.58 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.84 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.69 
 
 
161 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  35.2 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.89 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.43 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.43 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.43 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.43 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  33.33 
 
 
325 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.43 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.43 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  31.75 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.43 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.43 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.43 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.43 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.03 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.43 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.23 
 
 
164 aa  57.8  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.03 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.73 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  33.65 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  25.89 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.77 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  30.63 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.77 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.73 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.48 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.77 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  33.33 
 
 
163 aa  54.3  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.79 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  34.13 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.81 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.81 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.81 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.81 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.81 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  30.1 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.81 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.77 
 
 
159 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  28.48 
 
 
205 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  31.03 
 
 
276 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  28.8 
 
 
907 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.85 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 
159 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  23.85 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  23.85 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  33.33 
 
 
275 aa  50.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  34.04 
 
 
170 aa  51.2  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  29.7 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  31.91 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  26.73 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  19.82 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  25.23 
 
 
466 aa  48.5  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  28.7 
 
 
262 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.72 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  25.51 
 
 
141 aa  47.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  26.73 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  26.73 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  28.3 
 
 
154 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  31.63 
 
 
140 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  38.68 
 
 
141 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  26.53 
 
 
167 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  28.22 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  22.77 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  37.76 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  22.73 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  22.77 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  25.74 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  28.7 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  28.3 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  22.77 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  30.69 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  28.57 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  33.33 
 
 
568 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  24.75 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  24.19 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  25 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  24.74 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.07 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  32.29 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  32.05 
 
 
533 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.37 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  35.85 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  27.43 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  32.29 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  28.16 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  24.49 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  32.29 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  27.27 
 
 
779 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  23.15 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  35.38 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>