More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1730 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
331 aa  678    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.85 
 
 
332 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.85 
 
 
332 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.12 
 
 
336 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
333 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.76 
 
 
333 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  58.02 
 
 
403 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.55 
 
 
333 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  58.21 
 
 
340 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.22 
 
 
333 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.93 
 
 
333 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.22 
 
 
333 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  55.79 
 
 
327 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.33 
 
 
327 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28845  predicted protein  56.35 
 
 
386 aa  360  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02451  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.04 
 
 
333 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.79 
 
 
356 aa  358  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 
327 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.73 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
328 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.03 
 
 
328 aa  354  8.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
327 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.33 
 
 
328 aa  353  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.64 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.1 
 
 
333 aa  347  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.98 
 
 
350 aa  347  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
334 aa  345  7e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.94 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.75 
 
 
329 aa  342  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 
320 aa  342  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.74 
 
 
335 aa  342  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.05 
 
 
334 aa  341  9e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 
335 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 
335 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.99 
 
 
338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.91 
 
 
328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.84 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 
322 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  53.23 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.84 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  53.09 
 
 
321 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.08 
 
 
326 aa  335  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.35 
 
 
358 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.24 
 
 
341 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.13 
 
 
335 aa  332  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.37 
 
 
355 aa  332  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.52 
 
 
335 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.11 
 
 
352 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.33 
 
 
351 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.9 
 
 
350 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.33 
 
 
351 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  54.13 
 
 
338 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 
334 aa  329  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1051  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 
349 aa  329  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00488786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.64 
 
 
351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.45 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.45 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
332 aa  328  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.51 
 
 
350 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
332 aa  328  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.36 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  52.4 
 
 
336 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.07 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.37 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.05 
 
 
329 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0001  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.94 
 
 
333 aa  325  5e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.2 
 
 
350 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.68 
 
 
338 aa  325  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.93 
 
 
327 aa  325  6e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.84 
 
 
331 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.24 
 
 
341 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
331 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
354 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
362 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.21 
 
 
337 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
354 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
332 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
334 aa  323  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
332 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.85 
 
 
334 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
332 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.66 
 
 
352 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
332 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
362 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.21 
 
 
352 aa  322  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.99 
 
 
338 aa  322  7e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
326 aa  322  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
324 aa  321  8e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
327 aa  322  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.23 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  51.99 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.14 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 
330 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.61 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>