More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6150 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 354 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  74.79 
 
 		 361 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  68.36 
 
 		 357 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  69.21 
 
 		 357 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  69.21 
 
 		 357 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  69.21 
 
 		 357 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  74.14 
 
 		 358 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  70.77 
 
 		 350 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  68.45 
 
 		 356 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  68.38 
 
 		 357 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  69.23 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  69.34 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  70.29 
 
 		 363 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  69.05 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  70.19 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  71.35 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  66.01 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  67.24 
 
 		 367 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  69.12 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  69.6 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  70.37 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  70.37 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  68.3 
 
 		 364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  65.35 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  63.93 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  67.84 
 
 		 364 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  66.48 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  64.56 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  57.76 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  56.48 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  63.1 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  65.34 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  61.8 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  66.77 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 357 aa  353  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 357 aa  352  7e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 		 356 aa  352  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 		 378 aa  348  7e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.31 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 359 aa  342  8e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  48.2 
 
 		 355 aa  338  5.9999999999999996e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  46.85 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 357 aa  336  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  46.91 
 
 		 353 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 360 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 361 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.49 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 360 aa  331  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 360 aa  332  9e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.59 
 
 		 360 aa  332  9e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  51.02 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  46.46 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 357 aa  328  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 355 aa  328  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  48.34 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  47.34 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>