More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5694 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5694  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 456 aa  901    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3546  sodium:dicarboxylate symporter  67.73 
 
 		 509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06750  Na+/H+ dicarboxylate symporter  61.4 
 
 		 483 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  51.82 
 
 		 437 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  51.14 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  50.56 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.26 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.59 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  52.53 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  51.54 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  51.54 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.9 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.54 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.54 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.54 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  51.54 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.54 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.9 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.54 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.53 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  47.52 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.68 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  47.52 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  48.07 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.7 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  49.66 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  50.67 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.87 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.1 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.57 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.87 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.87 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.33 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.43 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.81 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  47.66 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  48.97 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.59 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.17 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.34 
 
 		 450 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.12 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.67 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.35 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  49.77 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.77 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  49.4 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.65 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.95 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.95 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.95 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.35 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.95 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.42 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.95 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  49.4 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.96 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.78 
 
 		 444 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.12 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  48.84 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  49.4 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2297  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 450 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372192  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.52 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  50.23 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  49.4 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  48.46 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.23 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2859  sodium:dicarboxylate symporter  50.23 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.74 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.19 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  47.62 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  47.62 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2241  sodium:dicarboxylate symporter  46.99 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  50.48 
 
 		 425 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  47.66 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.21 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  49.04 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  49.18 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1507  sodium:dicarboxylate symporter  50.11 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2743  C4-dicarboxylate transport protein  44.69 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  46.75 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4205  C4-dicarboxylate transport protein  48.83 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.63 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  45.82 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  48.22 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  47.65 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2035  sodium:dicarboxylate symporter  47.29 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0294  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.14 
 
 		 449 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4108  sodium:dicarboxylate symporter  47.8 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.61 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.26 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5153  sodium:dicarboxylate symporter  47.09 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.26 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.09 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.49 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0264  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.92 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.608146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  44.47 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>