More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5153 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4063  C4-dicarboxylate transport protein  94.71 
 
 		 435 aa  809    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2773  Sodium:dicarboxylate symporter  96.78 
 
 		 435 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5153  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 435 aa  863    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0462  sodium:dicarboxylate symporter  65.58 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3554  sodium:dicarboxylate symporter  60.64 
 
 		 455 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5393  sodium:dicarboxylate symporter  58.74 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6387  sodium:dicarboxylate symporter  60.72 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3356  Sodium/dicarboxylate symporter  61.06 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2501  sodium:dicarboxylate symporter  60.34 
 
 		 452 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235664  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  55.17 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  54.93 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.93 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.93 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.96 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.25 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.93 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.48 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  55.17 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.93 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.93 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31210  C4-dicarboxylate transport protein  54.19 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.93 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0995  C4-dicarboxylate transport transmembrane protein  54.68 
 
 		 447 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.37068  normal  0.0301599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  53.25 
 
 		 440 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.42 
 
 		 465 aa  464  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  53.25 
 
 		 440 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  53.25 
 
 		 440 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.72 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.92 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  55.85 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2841  sodium:dicarboxylate symporter  57.28 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.9 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  53.96 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  55.15 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.66 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.23 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.23 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.23 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.66 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.93 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  55.1 
 
 		 437 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  50.47 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.71 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  50.7 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.72 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.97 
 
 		 451 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.4 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.49 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  52.14 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.96 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.38 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.24 
 
 		 440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.48 
 
 		 440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.96 
 
 		 444 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.01 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.01 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3460  sodium:dicarboxylate symporter  50.96 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.01 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.83 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.01 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.22 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.01 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.05 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.64 
 
 		 447 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  51.46 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.66 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  51.24 
 
 		 449 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  50.83 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  51.99 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  50.61 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  51.99 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.16 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  49.65 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.21 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.94 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1872  C4-dicarboxylate transporter  52.99 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  49.65 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.47 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.45 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.7 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.7 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  48.5 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.7 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.21 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.47 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  48.5 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.18 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.97 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.97 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.97 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.48 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.97 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.97 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.04 
 
 		 448 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.98 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.97 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.97 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>