39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4549 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 690 aa  1356    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.94 
 
 		 868 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.83 
 
 		 732 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3119  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.83 
 
 		 732 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449622  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3882  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.44 
 
 		 511 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1260  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.96 
 
 		 477 aa  110  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1258  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.84 
 
 		 359 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1257  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 		 528 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1261  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.21 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1255  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.46 
 
 		 180 aa  88.2  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  32.47 
 
 		 463 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3118  hypothetical protein  35.42 
 
 		 186 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276552  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3877  hypothetical protein  30.63 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3348  hypothetical protein  38.84 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105558  decreased coverage  0.0000266846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1328 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  26.4 
 
 		 649 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  27.32 
 
 		 514 aa  55.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.61 
 
 		 275 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0330  FG-GAP repeat protein  27.78 
 
 		 732 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.87032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  28.07 
 
 		 491 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6179  peptidase M12A astacin  27.78 
 
 		 615 aa  51.2  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0299292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.83 
 
 		 1490 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.83 
 
 		 1201 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1289 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.63 
 
 		 1094 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  31.9 
 
 		 639 aa  48.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  26.07 
 
 		 2528 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  31.67 
 
 		 273 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  25.82 
 
 		 534 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.99 
 
 		 1346 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3741  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.27 
 
 		 257 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  23.9 
 
 		 1348 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 		 616 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  24.67 
 
 		 660 aa  44.3  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  30.83 
 
 		 2474 aa  44.3  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.37 
 
 		 270 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  25.1 
 
 		 386 aa  44.3  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  28.11 
 
 		 392 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>