81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0861 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 179 aa  342  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  54.04 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  52.32 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0440  protein of unknown function DUF1470  48.15 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  42.58 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  35.96 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  35.09 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  35.09 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  38.32 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  32.39 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  37.97 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  47.83 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  52.94 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  32.46 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  36.25 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  31.35 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  35.88 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  43.4 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  35.58 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  50 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  50 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  48.98 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  48.98 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  32.12 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  45.28 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  29.38 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  47.92 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  47.92 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  30.49 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  30.59 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  43.75 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  28.65 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  33.9 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  32.23 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  45.65 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  37.31 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  31.36 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  30.11 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  38.78 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  42.55 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  38.98 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  46.51 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  24.86 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  42.22 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  40.48 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  47.06 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  36.96 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  42.86 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  44.74 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  39.29 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  30 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  47.22 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  44.74 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0464  protein of unknown function DUF1470  43.9 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  34.78 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  31.75 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  27.34 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  27.34 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  53.12 
 
 		 202 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  34.18 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  25.4 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  42.59 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  26.03 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  44.44 
 
 		 233 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  36.36 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  40.35 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>