More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4276 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  100 
 
 		 112 aa  230  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  88.29 
 
 		 113 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  88.29 
 
 		 113 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  62.83 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 222 aa  73.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 242 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  33.98 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.58 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.58 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  38 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  36.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  36.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  39.05 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  34.69 
 
 		 234 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  33.96 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  36.7 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  34.34 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  37.11 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  38 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  37 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  34.78 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 174 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4316  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 180 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 180 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 176 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>