63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3375 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3375    100 
 
 		 279 bp  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  89.27 
 
 		 852 bp  295  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    88.89 
 
 		 912 bp  287  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  84.25 
 
 		 849 bp  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  84.25 
 
 		 849 bp  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  83.76 
 
 		 912 bp  163  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  83.76 
 
 		 849 bp  137  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  83.76 
 
 		 849 bp  137  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  81.78 
 
 		 858 bp  127  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  81.78 
 
 		 858 bp  127  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  81.78 
 
 		 858 bp  127  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  81.78 
 
 		 858 bp  127  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  81.78 
 
 		 858 bp  127  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  88.18 
 
 		 915 bp  115  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  86.89 
 
 		 915 bp  115  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  80.93 
 
 		 906 bp  111  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  80.74 
 
 		 852 bp  107  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    86.54 
 
 		 916 bp  95.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2492    81.93 
 
 		 565 bp  91.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0258476 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6152    84.75 
 
 		 249 bp  91.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  86.27 
 
 		 915 bp  91.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  86.32 
 
 		 900 bp  85.7  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  86.32 
 
 		 900 bp  85.7  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  85.26 
 
 		 906 bp  77.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  85.26 
 
 		 906 bp  77.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    85.71 
 
 		 943 bp  77.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1616    85.71 
 
 		 793 bp  77.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  79.06 
 
 		 855 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  79.06 
 
 		 855 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  79.06 
 
 		 855 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  79.06 
 
 		 855 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  93.88 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  93.88 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    93.88 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  93.88 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  93.88 
 
 		 450 bp  73.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0133  transposase subunit; putative  93.88 
 
 		 207 bp  73.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  84.38 
 
 		 906 bp  71.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 837 bp  67.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  91.84 
 
 		 906 bp  65.9  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  83 
 
 		 735 bp  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02251  transposase  88.68 
 
 		 177 bp  58  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    85.29 
 
 		 2015 bp  56  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  89.58 
 
 		 906 bp  56  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    86.44 
 
 		 802 bp  54  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2037  transposase subunit; putative  88.24 
 
 		 279 bp  54  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  83.13 
 
 		 774 bp  54  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  83.78 
 
 		 936 bp  52  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 906 bp  52  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0465    90.48 
 
 		 141 bp  52  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  78.38 
 
 		 906 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  78.38 
 
 		 906 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0647  transposase subunit; putative  87.76 
 
 		 120 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  85.71 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    81.52 
 
 		 279 bp  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  81.52 
 
 		 906 bp  48.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  81.52 
 
 		 906 bp  48.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    88.64 
 
 		 2389 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 906 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 906 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 906 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1703    93.75 
 
 		 641 bp  48.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  86.27 
 
 		 345 bp  46.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>