27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3039 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  100 
 
 		 341 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  34.41 
 
 		 501 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  29.58 
 
 		 785 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.06 
 
 		 754 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  27.71 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  24.35 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.35 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  28.15 
 
 		 452 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  27.04 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25.56 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  27.07 
 
 		 474 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  26.91 
 
 		 930 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4815  O-antigen polymerase  29.55 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.629862  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  30.81 
 
 		 402 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  23.19 
 
 		 594 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1584  O-antigen polymerase  26.77 
 
 		 463 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.791545  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3440  O-antigen polymerase  35.54 
 
 		 508 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  28.85 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  24.29 
 
 		 561 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  25.89 
 
 		 474 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  22.45 
 
 		 1070 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 446 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1492  hypothetical protein  25.71 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>