41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2484 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2484  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 169 aa  333  9e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.01974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1376  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  99.41 
 
 		 169 aa  330  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1608  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  68.05 
 
 		 169 aa  217  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2338  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  71.6 
 
 		 169 aa  215  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1773  hypothetical protein  61.54 
 
 		 169 aa  184  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0524  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  52.33 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.47 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.940799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1412  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  42.86 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1778  hypothetical protein  37.82 
 
 		 200 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0357  hypothetical protein  34.18 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0895709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1036  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  35.03 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.965838  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2076  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  37.09 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1875  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  34.46 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00459438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3298  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1025  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.92 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.045195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4929  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  35.43 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.371415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3452  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  27.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0558  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.58 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3097  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.71 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739132  normal  0.502747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0643  hypothetical protein  32.39 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0648569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3714  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.66 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000556878  n/a   
 
 
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  29.75 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0606  hypothetical protein  33.1 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.08 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455407  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1662  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.74 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.892075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1387  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.74 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3154  TRAP transporter-DctQ subunit putative  30.43 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2910  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.28 
 
 		 230 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4737  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.3 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0654  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.51 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.197985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0271  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3474  putative TRAP C4-dicarboxylate transport system, DctQ subunit (small permease component)  24.5 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2045  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.94 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.366338 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1202  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.66 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00964001  normal  0.857795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3654  TRAP transporter DctQ family protein  46.27 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0130  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  21.15 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.3 
 
 		 241 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3208  hypothetical protein  28.48 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1218  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  27.1 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3518  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.08 
 
 		 211 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  25.51 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>