32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2203 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  81 
 
 		 1321 aa  2234    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  39.01 
 
 		 1314 aa  718    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  39.32 
 
 		 1252 aa  700    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  37.94 
 
 		 1254 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  40.4 
 
 		 1287 aa  771    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  40.19 
 
 		 1226 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  48.69 
 
 		 1323 aa  1060    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  37.58 
 
 		 1188 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  82.35 
 
 		 1332 aa  2278    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1339 aa  2761    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  39.43 
 
 		 1220 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  39.02 
 
 		 1235 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  61.06 
 
 		 1285 aa  1580    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  38.97 
 
 		 1374 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  39.43 
 
 		 1220 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  35.81 
 
 		 1131 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  35.82 
 
 		 1101 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  36.42 
 
 		 1159 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  36.25 
 
 		 1062 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  34.62 
 
 		 1173 aa  492  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  34.41 
 
 		 1071 aa  466  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  33.3 
 
 		 1063 aa  462  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  32.15 
 
 		 1215 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  33.49 
 
 		 1162 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 1201 aa  239  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 1401 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  26.13 
 
 		 1401 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 		 1189 aa  193  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  27.1 
 
 		 1424 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.75 
 
 		 1082 aa  179  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  24.51 
 
 		 1410 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2392  hypothetical protein  38.46 
 
 		 368 aa  45.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313005  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>