236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1668 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1668  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 508 aa  1018    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.325623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  57.24 
 
 		 526 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  53.8 
 
 		 518 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  54.01 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  53.13 
 
 		 519 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  52.8 
 
 		 567 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  52.05 
 
 		 544 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  52.8 
 
 		 567 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  52.8 
 
 		 567 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  54.17 
 
 		 553 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  52.71 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  51.91 
 
 		 606 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  56.84 
 
 		 526 aa  467  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  53.15 
 
 		 545 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  51.61 
 
 		 551 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  51.48 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  54.47 
 
 		 544 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  45.88 
 
 		 482 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  47.21 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  47.15 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  48.82 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  46.67 
 
 		 481 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  46.35 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  48.82 
 
 		 469 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  46.09 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  48.39 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  48.11 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  49.68 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  48.17 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  47.96 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  47.53 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  50.75 
 
 		 488 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  46.3 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  45.18 
 
 		 470 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  48.51 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  45.84 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  47.56 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  49.25 
 
 		 470 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  45.91 
 
 		 482 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  46.47 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  47.11 
 
 		 480 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  49.89 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  43.83 
 
 		 488 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  46.67 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  46.35 
 
 		 487 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  49.47 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  47.65 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  46.57 
 
 		 469 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  46.04 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  46.35 
 
 		 469 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  47.31 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  44.59 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  46.45 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  45.73 
 
 		 484 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  45.61 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  46.07 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  48.3 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  48.87 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  45.73 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  46.7 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  44.76 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  45.81 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  47.45 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  47.63 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  44.12 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  45.49 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  45.16 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  45.15 
 
 		 518 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  47.78 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  45.71 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  44.21 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  43.78 
 
 		 479 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  45.71 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  45.19 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  45.92 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  46.58 
 
 		 489 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  45.92 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  44.56 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  45.76 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  45.16 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  45.73 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  44.3 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  45.34 
 
 		 518 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  43.95 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  45.2 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  45.2 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  45.2 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  44.42 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  44.32 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  44.64 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  43.78 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  43.78 
 
 		 489 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  47.42 
 
 		 507 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  45.2 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  44.51 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  44.73 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  45.2 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  45.2 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  44.64 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  45.2 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>