29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1448 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  812    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  35.29 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  32.57 
 
 		 561 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 529 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  30.2 
 
 		 548 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  31.2 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  30.28 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  29.8 
 
 		 566 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 566 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 515 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  32.01 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  32.25 
 
 		 548 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 663 aa  94.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  33.77 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  28.49 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  36.36 
 
 		 532 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.78 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.78 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>