More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0774 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0774  glutamate 5-kinase  100 
 
 		 362 aa  696    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.08 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  41.08 
 
 		 382 aa  258  8e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.29 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.3 
 
 		 372 aa  255  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.38 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 394 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.01 
 
 		 374 aa  248  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.37 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  37.43 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 		 374 aa  246  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  43.09 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  43.9 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  40.87 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  40.87 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  40.6 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  43.96 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  40.6 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  41.19 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  41.42 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  43.99 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  41.99 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 		 376 aa  235  7e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  41.76 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  41.76 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  40.33 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  41.21 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  40.11 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  38.8 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  40.33 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  41.21 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  38.96 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  39.78 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  37.6 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  39.45 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  40.11 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  41.16 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 		 367 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  42.74 
 
 		 374 aa  228  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  38.69 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  39.76 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  40.55 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  39.51 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  36.96 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  36.96 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  40.6 
 
 		 379 aa  225  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  38.44 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  40.92 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  41.76 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  38.25 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  42.47 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  42.47 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  41.37 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  40.32 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  41.8 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  41.94 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  41.37 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>