More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0371 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  58.7 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  58.7 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.74 
 
 
171 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.56 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.16 
 
 
194 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  61.36 
 
 
199 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.52 
 
 
203 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  59.56 
 
 
218 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.78 
 
 
175 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  56.74 
 
 
171 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.88 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.57 
 
 
226 aa  164  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  58.7 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  57.78 
 
 
174 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.46 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  57.78 
 
 
183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  54.35 
 
 
188 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  54.35 
 
 
187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  56.72 
 
 
174 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  56.72 
 
 
174 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  56.72 
 
 
174 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.04 
 
 
300 aa  161  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.65 
 
 
167 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  57.04 
 
 
175 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.03 
 
 
179 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.56 
 
 
185 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  53.24 
 
 
211 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  52.94 
 
 
211 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  53.08 
 
 
185 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.9 
 
 
214 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  55 
 
 
252 aa  155  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.97 
 
 
199 aa  154  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  44.57 
 
 
177 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
168 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.68 
 
 
165 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.94 
 
 
165 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.26 
 
 
177 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  42 
 
 
169 aa  125  8.000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  43.17 
 
 
162 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  43.17 
 
 
164 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
163 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
162 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.23 
 
 
165 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  44.53 
 
 
163 aa  121  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
167 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  43.88 
 
 
164 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  44.7 
 
 
163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  44.7 
 
 
163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  43.07 
 
 
164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
162 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  38.19 
 
 
163 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 
162 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.79 
 
 
175 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 
163 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  43.61 
 
 
163 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 
162 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  39.01 
 
 
163 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
164 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  41.43 
 
 
163 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  38.79 
 
 
160 aa  119  6e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
163 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
162 aa  118  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 
162 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  43.61 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  41.43 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  40.88 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  42.54 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  38.73 
 
 
162 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
162 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  39.29 
 
 
162 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  40.88 
 
 
164 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  43.8 
 
 
163 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  42.25 
 
 
176 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  40.41 
 
 
169 aa  115  5e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
163 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  38.56 
 
 
167 aa  115  6e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
162 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
162 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  40.43 
 
 
176 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
163 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.64 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  40 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  43.51 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  39.29 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  42.97 
 
 
161 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  41.43 
 
 
163 aa  113  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  38.57 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.51 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  38.57 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  38.03 
 
 
162 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  34.76 
 
 
162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
165 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  38.41 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>