More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0940 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0940  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
338 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.528842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0998  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  96.75 
 
 
338 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1001  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  96.75 
 
 
338 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0982  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  75.14 
 
 
351 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00231711  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1111  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  42.5 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6579  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  43.9 
 
 
330 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2244  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  45.57 
 
 
336 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.171072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0257  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  47.01 
 
 
330 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2202  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  40.73 
 
 
349 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000104234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2017  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  40.12 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7913  terminal oxidase subunit II  42.33 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5646  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  37.54 
 
 
341 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0303  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  41.52 
 
 
338 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2613  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  33.53 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.251199 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1394  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  32.22 
 
 
339 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0429181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2687  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  36.18 
 
 
345 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3724  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2- like protein  39.94 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.77992  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1656  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.76 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2132  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.79 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.19324  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3857  hypothetical protein  30.3 
 
 
335 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346842  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3332  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.93 
 
 
335 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223334  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.66 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4073  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.58 
 
 
336 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.889217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000388  putative Cytochrome bd2 subunit II  27.58 
 
 
335 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4324  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.13 
 
 
334 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2189  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  32.07 
 
 
335 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3377  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.06 
 
 
335 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0260  hypothetical protein  28.02 
 
 
329 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1267  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.13 
 
 
334 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3574  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.36 
 
 
335 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0902156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0788  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.8 
 
 
335 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4892  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  31.19 
 
 
335 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2039  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.52 
 
 
341 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2528  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.63 
 
 
335 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3450  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.06 
 
 
335 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0942  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.4 
 
 
335 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1086  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.4 
 
 
335 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3592  Cytochrome bd type quinol oxidase subunit 2 protein  31.04 
 
 
334 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0913  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.06 
 
 
335 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1178  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.93 
 
 
335 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13040  CioB, cyanide insensitive terminal oxidase  29.93 
 
 
335 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0255  hypothetical protein  27.73 
 
 
329 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0929  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  25.84 
 
 
335 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1447  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.3 
 
 
344 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.777873  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1786  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2  28.01 
 
 
334 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.703016  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0091  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.64 
 
 
338 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243968  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5725  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.01 
 
 
335 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31475  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1421  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.3 
 
 
335 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4065  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.09 
 
 
334 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508288  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6408  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.3 
 
 
335 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6442  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.61 
 
 
335 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.42498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3152  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.53 
 
 
335 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3385  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  28.53 
 
 
338 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4379  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.39 
 
 
334 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5684  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.61 
 
 
335 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0927  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.06 
 
 
335 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.304728  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4158  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.08 
 
 
337 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119875  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1464  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  32.97 
 
 
344 aa  99.4  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4956  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  29.25 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.545349  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3838  quinol oxidase, subunit II  29.88 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4644  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.23 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39866  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6551  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  26.99 
 
 
335 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6191  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.19 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1026  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.59 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3839  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  26.89 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.425133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0963  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.36 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.238614  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0417  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.23 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4011  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.74 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7067  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.99 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660644  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6969  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  26.69 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3117  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  32.79 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2000  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.29 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4671  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.15 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297118  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1695  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.8 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0476582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4647  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  27.59 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.12 
 
 
335 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3210  quinol oxidase subunit II QxtB  27.88 
 
 
335 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4281  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  28.57 
 
 
335 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.207239  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3951  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.66 
 
 
335 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4650  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.78 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4116  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  31.38 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2044  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.69 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5401  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.73 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.117755  normal  0.0278093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11040  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  31.13 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0395  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  29.15 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0401  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II  29.15 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000259271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2643  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.15 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5280  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.34 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2149  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.19 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0413  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II  29.15 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306054 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1769  cyanide-insensitive terminal oxidase  29.53 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0427  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  29.53 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.12 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0334  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  30.87 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2101  cyanide-insensitive terminal oxidase  28.96 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1836  cyanide-insensitive terminal oxidase  28.96 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1516  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  29.8 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.475209  normal  0.900385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0392  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  29.15 
 
 
336 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  7.27607e-17 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1128  cyanide-insensitive terminal oxidase  28.96 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0455  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II  29.15 
 
 
336 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.458436  hitchhiker  0.00000000000000920194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>