More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2950 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  57.4 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  54.63 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  53.02 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  48.98 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  51.32 
 
 		 240 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  47.68 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  50.44 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  47.86 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  48.29 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  48.29 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  47.86 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  47.81 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  47.44 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  47.46 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.44 
 
 		 237 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  48.44 
 
 		 237 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  45.3 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  46.7 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  43.97 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  45.49 
 
 		 240 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  47.77 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 		 242 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  46.98 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.55 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.55 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  45.69 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.98 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  45.69 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  47.56 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 		 242 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  46.29 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  43.7 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.37 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  45.37 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  45.15 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  45.87 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  44.25 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  45.37 
 
 		 222 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  44.25 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.09 
 
 		 236 aa  188  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  46.72 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  46.22 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  45.78 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  43.91 
 
 		 231 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.45 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  44.21 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  43.42 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  43.42 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  43.05 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.41 
 
 		 247 aa  174  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.17 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  43.38 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  41.12 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  41.59 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  43.84 
 
 		 242 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  41.12 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  40.62 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  40.62 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  42.92 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  40.62 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  40.65 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  40.62 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  41.59 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  39.07 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  40.18 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.11 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  39.73 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  39.73 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  39.72 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  38.25 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  38.86 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  39.72 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  39.72 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  39.72 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  39.72 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  39.72 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  39.72 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  39.72 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  40.54 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  39.72 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  40.19 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  39.83 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  42.33 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  39.25 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  38.64 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  41.07 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>