72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2615 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2615  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  100 
 
 		 429 aa  830    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298091  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2472  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  59.03 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4613  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  59.15 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1479  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  59.15 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.805909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1664  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  58.38 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537362  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3541  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  57.75 
 
 		 386 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3313  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  57.14 
 
 		 386 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0042  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  49.2 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3232  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  57.85 
 
 		 382 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415956 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0041  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  49.72 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.299856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1661  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  49.31 
 
 		 400 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.431835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1992  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  49.31 
 
 		 400 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1047  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  44.68 
 
 		 387 aa  305  9.000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000418188  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1616  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, putative  47.79 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0457  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  49.45 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4643  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  49.73 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2839  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  52.46 
 
 		 378 aa  253  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09133  malate permease (Eurofung)  38.44 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0625395  normal  0.622615 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  35.96 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0433  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  40.51 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5153  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.21 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2282  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.07 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3375  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.81 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4384  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.15 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05110  sulfite transporter, putative  29.63 
 
 		 517 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.1 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3436  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.37 
 
 		 375 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2094  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.86 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0680  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.53 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1117  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.31 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0404  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.32 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11016  malic acid transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09410)  28.18 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4610  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.11 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44239  predicted protein  22.67 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.182141 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30901  predicted protein  25.83 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314839 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30900  predicted protein  23.71 
 
 		 449 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.192917  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.93 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01472  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04630)  23.8 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00510243  normal  0.213682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4856  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.09 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0594836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0897  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.58 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0526316  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0780  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.45 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3443  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.75 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.288016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2079  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2173  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.95 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0077  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.33 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1807  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.45 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4602  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.96 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.681396 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07797  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17660)  24.84 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0796042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2878  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.76 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4140  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.47 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1525  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.58 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0288585  normal  0.364123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1847  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, putative  26.58 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1964  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.87 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1761  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.17 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.41649  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0542  hypothetical protein  29.02 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30899  predicted protein  21.76 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.766697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3979  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.33 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.894801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1488  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.15 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22500  tellurite resistance protein-like permease  26.46 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.675884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1250  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.92 
 
 		 339 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4485  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.6 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2801  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.8 
 
 		 356 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2285  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.13 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3523  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.85 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371301  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0133  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.03 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1002  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1271  hypothetical protein  25.22 
 
 		 351 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3702  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.4 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322958  normal  0.371988 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.08 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.120937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0374  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.33 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2613  putative C4-dicarboxylate transporter  25.44 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1275  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.76 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>